PubMed Database
Workflows directs PubMed et E-utilities du NCBI : requêtes MeSH, recherche PMID, récupération de citations et veille documentaire reproductible.
- Quoi
- Workflows directs PubMed et E-utilities du NCBI : requêtes MeSH, recherche PMID, récupération de citations et veille documentaire reproductible.
- Coût
- Gratuit
- Prérequis
- Utilisez « Base PubMed » avec votre Muse.
- Installation
- Copiez le prompt d’installation ci-dessous dans votre Muse — votre agent fait le reste.
Sélectionné par Skill Harbor : un skill de recherche pour la littérature biomédicale qui va directement à PubMed plutôt qu'à la recherche web générale. Il enseigne la construction de requêtes avec opérateurs booléens et tags de champs PubMed (titre, résumé, auteur, journal, MeSH, type de publication, date, langue), la syntaxe des termes MeSH et sous-rubriques, et les filtres par type de publication et dates pour des passes façon revue systématique. Le workflow E-utilities du NCBI (esearch, esummary, efetch, elink) vient avec un exemple Python pour une veille documentaire reproductible adossée à l'API, plus une discipline de sortie : consignez la chaîne de recherche exacte, la base, la date, les filtres et le nombre de résultats pour que chaque passe soit reproductible. Une checklist de revue couvre les tags valides, le couplage MeSH plus texte libre pour les sujets récents, les plages de dates explicites, les clés API chargées depuis l'environnement et le respect des limites de débit. Par @affaan-m, listé ici avec crédit à son créateur. Tiré du dépôt affaan-m/ECC (MIT). Bémols honnêtes : pur guide, rien à installer ; une clé API NCBI et un email sont recommandés pour les scripts de production (gardez les clés en variables d'environnement, jamais dans les fichiers commités), et c'est un outil de recherche documentaire, pas un avis médical. Skill Harbor ne vérifie jamais le code, examinez-le vous-même avant usage.
Version :
Installation
Copiez le dossier d’installation ci-dessous, puis collez-le dans MuseLe prompt d'installation ci-dessous inclut déjà les étapes de vérification : votre agent suit la checklist communautaire avant d'installer tout ce qui contient du code exécutable. Vous en voulez plus ?
Utilisez « Base PubMed » avec votre Muse. Prérequis : aucun pour chercher (PubMed est gratuit). Pour un usage scripté des E-utilities, définissez NCBI_EMAIL et NCBI_API_KEY en variables d'environnement. Skill de pur guide, rien à installer. 1. Ouvrez le skill : https://github.com/affaan-m/ECC/blob/main/skills/scientific-db-pubmed-database/SKILL.md et copiez le texte complet du SKILL.md. 2. Collez-le dans un chat avec Muse et ajoutez : « Construis une requête PubMed pour [question de recherche] avec termes MeSH plus synonymes en texte libre, filtre de dates 2020:2026. » 3. Pour la veille, demandez : « Écris un script Python avec le workflow E-utilities pour lancer cette recherche chaque semaine et journaliser les résultats avec une discipline de sortie complète. » Astuce : couplez les termes MeSH avec des synonymes titre/résumé pour les sujets récents où la terminologie varie encore. Sécurité : un skill est du texte d'instructions ; il n'exécute rien tout seul. Gardez les clés API en variables d'environnement, respectez les limites de débit du NCBI, et rappelez-vous que c'est un outil de recherche documentaire, pas un avis médical.
Enregistré dans vos installs récentes. Retrouvez-le à tout moment sur /connect.
Questions
Comment installer une création ?
Chaque fiche produit contient un prompt d’installation à copier-coller. Collez-le dans votre Muse et il installe la création pour vous — sans configuration manuelle.
Où va mon argent ?
Directement au vendeur. Skill Harbor ne traite jamais les paiements : le paiement se fait sur la page du vendeur, généralement via Stripe.
Que signifie le ✓ à côté du nom d’un créateur ?
Il signifie que nous avons confirmé l’identité de la personne derrière la fiche. Il ne dit rien sur le code lui-même — vérifiez toujours une création avant de l’installer.